Η διάρκεια του Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών είναι 18 μήνες (1,5 χρόνος). Αποτελείται από δύο εξάμηνα φοίτησης και ένα εξάμηνο εκπόνησης της πτυχιακής εργασίας.
Τα μαθήματα συμβαίνουν στις εγκαταστάσεις του Πανεπιστημίου Πειραιά, συνήθως Δευτέρα έως Πέμπτη από 18:00 έως 21:00 (είναι δυνατό να πραγματοποιηθεί πρόσθετη διδασκαλία, κύρια, επικουρική ή σεμιναριακή ανάλογα με τις ανάγκες του Προγράμματος).
Το πρόγραμμα διαμορφώνεται ως εξής:
1ο Εξάμηνο (ΧΕΙΜΕΡΙΝΟ)
Το Α’ Εξάμηνο ξεκινά τον Οκτώβρη και ολοκληρώνεται τον Ιανουάριο. Περιλαμβάνει τέσσερα υποχρεωτικά μαθήματα. Κάθε μάθημα αποτελείται από 10 διαλέξεις ή εργαστηριακά μαθήματα. Μετά το πέρας του εξαμήνου ακολουθεί το Φεβρουάριο η εξεταστική περίοδος. Εκεί οι φοιτητές εξετάζονται για τις γνώσεις τους είτε μέσω εξετάσεων, είτε μέσω εκπόνησης απαλλακτικών εργασιών.
2ο Εξάμηνο (ΕΑΡΙΝΟ)
Το Β’ Εξάμηνο ξεκινά τον Μάρτιο και ολοκληρώνεται τον Ιούνιο. Περιλαμβάνει τέσσερα υποχρεωτικά μαθήματα. Κάθε μάθημα αποτελείται από 10 διαλέξεις ή εργαστηριακά μαθήματα. Μετά το πέρας του εξαμήνου ακολουθεί τον Ιούλιο η εξεταστική περίοδος. Εκεί οι φοιτητές εξετάζονται για τις γνώσεις τους είτε μέσω εξετάσεων, είτε μέσω εκπόνησης απαλλακτικών εργασιών.
3ο Εξάμηνο (ΧΕΙΜΕΡΙΝΟ)
Το Γ’ Εξάμηνο ξεκινά τον Οκτώβρη. Περιλαμβάνει την εκπόνηση της Μεταπτυχιακής Διπλωματικής Εργασίας (ΜΔΕ), σε συνεργασία με τους καθηγητές του τμήματος, η οποία επιβάλλεται να είναι υψηλού επιστημονικού επιπέδου και να καλύπτει ένα ευρύ φάσμα των γνώσεων που αποκτήθηκαν. Τα θέματα των διπλωματικών εργασιών επιλέγονται από τους Καθηγητές με γνώμονα αυτήν την θεώρηση.